A Magyar Környezetvédelmi és Vízügyi Múzeum – amely a vízügyi emlékhelyek hálózatának központja – Esztergom egyik legszebb barokk épületében kapott helyet.
A hajdan különálló Szenttamás község birtokosa – az esztergomi káptalan – építtetett itt magának uradalmi központot az 1730-as évek közepén, melynek a ma is álló ház volt a főépülete.
A ház már a XVIII. század Esztergomának is kiemelkedő jelentőségű és díszű épülete volt. Ezt bizonyítja az is, hogy 1790. február 20-án, II. József halálának éjjelén, útban Bécsből Buda felé itt őrizték a magyar királyi koronát. A Múzeum 1980. október 31-én nyitotta meg kapuit a közönség előtt.
A Múzeum 1980-ban megnyitott első állandó kiállításának címe: A Duna és a magyar vízgazdálkodás története. A kiállítást 18 évi működés után 1998-ban bontották le és ezzel kezdetét vette a múzeumépület teljes rekonstrukciója. A küllemében és a működés körülményeiben megújult Duna Múzeum 2001. október 9.-étől várja ismét látogatóit.
A kiállítás főbb tematikai egységei: a víz fizikai és kémiai tulajdonságai; vízszabályozások, árvizek, árvízvédelem, a magyar térképészet históriája; a vízellátás-csatornázás története, egyetemes és magyar technikai és vízügyi kronológia.