Sajátos módon az alapvető különbségek eltűnésével a kapcsolat átmenetileg meglazult, de az utóbbi időben már az új szemlélet jegyében ismét folytatódik a partnerség. A korábbi évtizedekben a két intézmény elsősorban mint kiállítóhely tartotta a kapcsolatot, de ez 2005-től megváltozott, és a múzeumi gyűjteményekre került a hangsúly. A Szombathelyi Képtár ekkor mutatta be nagy sikerrel minitextil gyűjteményét, míg a Muraszombati Galéria saját gyűjteményét mutatja be, ami a reveláció erejével hat, ugyanis a Muraszombati Galériát a köztudat csak kiállítóhelyként ismeri. Gyűjteményének kialakulása természetesen szoros összefüggésben van kiállításpolitikájával, amely mindig is a modern művészet mellett állt ki, és ebben kulcsszerepe van dr. Franc Obalnak, aki már évtizedek óta vezeti az intézményt. A kiállítás látogatói választ kapnak arra, hogy vajon milyen hasonlóságok és különbségek vannak a két ország kortárs művészetében, felfedezhető-e a korszaknak az a sajátossága, amikor a szocializmus mast jelentett az akkori Jugoszláviában és mást Magyarországon.
Muraszombati Galéria
A Muraszombati Galériával mindig is élénk kapcsolata volt a Szombathelyi Képtárnak, amelynek a kerete korábbiakban a Pannónia Triennálék kiállítássorozata volt. Ez a maga idejében nagy nagy mértékben hozzájárult a szomszédos országok közeledéséhez függetlenül a társadalmi, politikai berendezkedéstől.